Группу обвиняют в распространении фейковых новостей против судей.
Однако гигант социальных сетей заявил, что эта мера представляет угрозу свободе слова, и заявил, что будет обжаловать этот приказ.
Его платформа была использована для призыва к военному перевороту, чтобы закрыть Конгресс и Верховный суд.
В мае судья обязал Facebook блокировать аккаунты в Twitter и 12 другой 16.
В пятницу Верховный суд Бразилии оштрафовал Facebook на 1,92 млн реалов ($368 000; £280 000) за отказ блокировать доступ к аккаунтам по всему миру - он согласился блокировать доступ только к тем аккаунтам, которые могли быть доступны из Бразилии, - и еще на 100 000 реалов за каждый день, когда он не выполнял свои обязательства.
Было неясно, был ли также оштрафован Twitter.
Facebook находит британскую сеть фейковых новостей
Facebook заявил в своем заявлении, что этот порядок был экстремальным, "противоречащим законам и юрисдикциям по всему миру".
"Учитывая угрозу уголовной ответственности для местного служащего, на данный момент мы не видим другой альтернативы, кроме как выполнить решение путем блокировки счетов по всему миру, в то время как мы обращаемся в Верховный суд", - говорится в нем.
Среди заблокированных счетов-счета Роберто Джефферсона, лидера партии, лояльной президенту, и Лучано Ханга, одного из самых известных бразильских бизнесменов.
Facebook и Twitter находятся под растущим давлением, чтобы бороться с ненавистническими высказываниями и ложной информацией.
Facebook Instagram Facebook заблокировал десятки аккаунтов в Facebook и Instagram, которые, по его словам, были вовлечены в создание "вымышленных персонажей, выдающих себя за репортеров" и "маскирующихся под новостные каналы".
В нем говорилось, что он связал эти счета с сотрудниками конторы Мистера Больсонаро, его сыновьями Эдуардо и Флавио и другими.